Le laboratoire se structure, au-delà de ses trois axes thématiques, par des recherches transversales, « sur concept » ou thématique. En cohérence avec ce principe, tous les deux ans, l’unité propose à l’ensemble des chercheur·ses du LIAT de participer à une réflexion collective sur un thème ou une problématique donnée, rebattant la répartition entre les trois axes. Chaque chercheur·se est invité à déporter ses objets de recherche et approches vers ce questionnement, qui en retour influera sur le cours des recherches menées par les axes. Les recherches issues de ces thématiques transversales font systématiquement l’objet de publications collectives.
Ainsi, depuis sa création le LIAT a publié 11 ouvrages collectifs, appuyés ou non par un colloque international : Infrastructures, villes et territoires (colloque – 2000), Mobilité et esthétique. Deux dimensions des infrastructures territoriales (2001), Echelles et dimensions. Ville, architecture, territoire (2003), Le temps des infrastructures (2007), La métropole des infrastructures (colloque – 2009), Imaginaires d’infrastructures (2009), L’infraville. Futur des infrastructures (colloque – 2011), Afriques. Architectures, infrastructures et territoires en devenir(2015), Politiques des infrastructures. Permanence, effacement, disparition (2018), Public. Infrastructure, architecture, territoire (2021), Magie. La déraison des infrastructure (2024).